• Образован в июне 1935 года приказом НКПС (МПС).
• В 1954 году передан в состав Минтрансстроя СССР, с 1992 года работает в системе Корпорации "Трансстрой".
• В 1993 году преобразован в открытое акционерное общество (ОАО ЦНИИС).

В системе Госстроя России ЦНИИС является головной организацией по научным исследованиям, стандартизации и нормированию в области проектирования, строительства и реконструкции:
- железных дорог (включая электрификацию);
- тоннелей и метрополитенов;
- мостов;
- транспортных гидротехнических сооружений;
- транспортных зданий;
- инженерной защиты объектов и сооружений транспорта.

• ЦНИИС имеет государственную аккредитацию научной организации (свидетельство №2766 от 27.06.2001, выданное Министерством науки и технологий РФ).
• В соответствии с лицензиями Госстроя и Госкомэкологии России, аттестатами аккредитации Госстандарта России ЦНИИС:
  - выполняет работы по инженерным изысканиям, проектированию, строительству и реконструкции транспортных объектов, в том числе на территориях со сложными геолого-климатическими условиями;
  - проводит работы по обследованию технического состояния сооружений, испытанию материалов, конструкций, сооружений, строительных машин и оборудования, сертификации продукции в строительстве с выдачей сертификатов соответствия в системе ГОСТ-Р;
  - осуществляет оценку воздействия строительства на окружающую среду, экологическую паспортизацию, разработку норм ПДВ.

Институт обладает высоким научным потенциалом. В разное время в ЦНИИСе работали такие выдающиеся ученые с мировым именем, как К.С.Силин, А.А.Луга, В.С.Лукьянов, О.Я.Берг, К.П.Большаков, Я.А.Дорман, В.Л.Маковский, Н.М.Колоколов, Н.Б.Лялин, Б.Е.Улицкий, Д.И.Федоров, С.В.Шестоперов. Ими созданы научные школы по актуальным проблемам транспортного строительства, известные как в России, так и за рубежом.
В настоящее время в институте работает 21 доктор наук, свыше 100 кандидатов наук, 12 действительных членов российских и зарубежных академий наук, лауреаты Государственных премий и Премий Правительства РФ, Заслуженные деятели науки и техники, Заслуженные изобретатели, Заслуженные строители и Почетные транспортные строители. Для выполнения комплекса работ институт имеет новейшие средства испытаний, обработки и анализа получаемой информации, современную вычислительную технику и оборудование, располагает экспериментальной базой площадью свыше 30 тыс. м2 со специализированными стендами, технической и патентной библиотеками, библиотекой норм и стандартов. Под руководством института и при его участии разработаны основные нормативные документы по транспортному строительству.

Эффективные методы расчета, современные конструкции, технологии сооружения, новые материалы и оборудование, разработанные специалистами института, использовались и используются при изысканиях, проектировании, строительстве и реконструкции таких уникальных объектов транспорта, как железные дороги Абакан-Тайшет, Тюмень-Тобольск-Сургут, Сургут-Уренгой-Ямбург, Чара-Чина; внеклассные мосты через реки Обь, Иртыш, Ангара, Амур, Волга, Енисей, Днепр, Даугава, Ока; метрополитены в Москве, Ленинграде, Новосибирске, Свердловске, Минске; Дворец Спорта в Лужниках; МКАД; Третье транспортное кольцо в г. Москве.

Многие разработки института отмечены Государственными премиями, премиями Правительства России, дипломами международных выставок. Институтом получено свыше 1600 авторских свидетельств на изобретения, в том числе за последние 5 лет получено около 100 патентов и свидетельств РФ на изобретения и полезные модели, продано 9 лицензий на передачу ноу-хау инофирмам таких стран, как Япония, Германия, Италия, Сирия, Чехия, заключено 12 лицензионных соглашений с российскими строительными организациями. Институт сертифицирован по международному стандарту качества ИСО 9001:2000.

Институт разрабатывает:

• государственные стандарты (ГОСТ), строительные нормы и правила (СНиП), строительно-технологические нормы (СТН) и другие нормативные и методические документы в области проектирования, строительства и реконструкции транспортных сооружений, в том числе в суровых климатических условиях и в сейсмически опасных районах;
• новые прогрессивные конструкции, материалы и технологии сооружения строительных объектов с повышенной степенью заводской готовности;
• рекомендации по применению различных материалов и методов сооружения дорог, тоннелей, мостов, устройств электрификации и других строительных объектов, в том числе в сложных природно-климатических условиях (вечная мерзлота, сейсмика и т.д.);
• проектно-сметную документацию на строительство, ремонт, усиление и реконструкцию строительных объектов различного назначения;
• методы повышения надёжности объектов строительства в сложных природно-климатических условиях (вечная мерзлота, сейсмика);
• средства механизации и автоматизации технологических процессов для транспортного и других видов строительства;
• стационарные и мобильные средства испытаний, измерений и диагностики для определения характеристик машин, оборудования, строительных конструкций и сооружений;
• новые методы гидравлического и математического моделирования гидро- и литодинамических процессов в прибрежной зоне моря с целью оценки современного состояния рассматриваемого побережья и тенденций его развития;
• эффективные, экономически целесообразные биопозитивные конструкции берегозащитных сооружений, технологии их строительства и комплексной механизации строительных работ;
• технологические регламенты на специальные и сложные работы;
• системы комплексной инженерной защиты объектов и сооружений транспорта;
• инженерные методы в системе управления тепловым режимом и напряжённо-деформированным состоянием грунтовых сооружений и оснований;
• программы для ЭВМ по расчету и проектированию транспортных сооружений.

С 1942 года в институте действуют аспирантура и докторантура. Работает докторский диссертационный совет, утвержденный ВАК Минобразования России, рассматривающий докторские и кандидатские диссертации по основным научным направлениям транспортного строительства. В настоящее время в институте обучается 50 аспирантов. Защищаемость диссертаций аспирантами - более 60%.

ОАО ЦНИИС трижды - в 2002 - 2004 гг. являлся Лауреатом Всероссийского конкурса научных организаций строительного комплекса России (Стройнаука).